MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 9650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021521	AT	3	6	99	104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021521	CCA	2	6	181	186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_021521	GC	3	6	214	219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021521	GTT	2	6	289	294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021521	T	6	6	355	360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021521	A	6	6	361	366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021521	A	6	6	426	431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021521	A	6	6	954	959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021521	ACA	2	6	1043	1048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021521	AAAT	2	8	1052	1059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021521	TTA	2	6	1089	1094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021521	CAA	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021521	ATC	2	6	1160	1165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021521	A	6	6	1176	1181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021521	A	6	6	1209	1214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021521	GTT	2	6	1237	1242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021521	CAG	2	6	1335	1340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021521	TGT	2	6	1343	1348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021521	AAT	2	6	1421	1426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021521	AAT	2	6	1429	1434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021521	TGT	2	6	1467	1472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021521	CTTT	2	8	1476	1483	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021521	GGT	2	6	1484	1489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021521	TTG	2	6	1541	1546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021521	ATT	2	6	1550	1555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021521	TTTG	2	8	1563	1570	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021521	CA	3	6	1667	1672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021521	TAAA	2	8	1734	1741	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021521	A	6	6	1779	1784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021521	A	6	6	1883	1888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021521	TTG	2	6	1912	1917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021521	TTTC	2	8	1953	1960	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021521	GT	3	6	2093	2098	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021521	CTTG	2	8	2132	2139	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021521	AGT	2	6	2186	2191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021521	TTGC	2	8	3279	3286	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_021521	A	6	6	3293	3298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021521	TGAT	2	8	3307	3314	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021521	A	6	6	3336	3341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021521	A	6	6	3388	3393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021521	A	6	6	3416	3421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021521	TTAT	2	8	3431	3438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021521	T	7	7	3444	3450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021521	TAA	2	6	3474	3479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021521	TTTG	2	8	3493	3500	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021521	GTTG	2	8	3544	3551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021521	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021521	ATTA	2	8	3684	3691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021521	T	6	6	3729	3734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021521	TGT	2	6	5241	5246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021521	TGT	2	6	5264	5269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021521	GTT	2	6	5284	5289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021521	ATT	2	6	5335	5340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021521	TAAA	2	8	5358	5365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021521	TAT	2	6	5386	5391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021521	T	6	6	5391	5396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021521	GAT	2	6	6828	6833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021521	ACA	2	6	6836	6841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021521	AT	3	6	7365	7370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021521	AT	3	6	7390	7395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021521	TGG	2	6	7447	7452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021521	CGT	3	9	7511	7519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021521	TTAA	2	8	7786	7793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021521	TG	3	6	12084	12089	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021521	TGT	2	6	12133	12138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021521	ATT	2	6	12151	12156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021521	TGA	2	6	12171	12176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021521	TAC	2	6	16125	16130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021521	TAT	2	6	16146	16151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021521	T	6	6	16151	16156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021521	GCTT	2	8	16181	16188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021521	T	6	6	16830	16835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021521	ATA	2	6	17667	17672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021521	AT	3	6	17693	17698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021521	T	6	6	17698	17703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021521	ATT	2	6	17710	17715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021521	CTTT	2	8	18709	18716	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021521	ACT	2	6	19698	19703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021521	ATAG	2	8	19710	19717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021521	A	6	6	19729	19734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021521	A	6	6	20715	20720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021521	CT	3	6	24968	24973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021521	TTA	2	6	25009	25014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021521	GGA	2	6	25041	25046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021521	AAT	2	6	25109	25114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021521	GTTT	2	8	25165	25172	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021521	AATC	2	8	25182	25189	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021521	AGA	2	6	25222	25227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021521	ATT	2	6	25234	25239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021521	T	6	6	25284	25289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021521	CTA	2	6	25304	25309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021521	AT	3	6	25317	25322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021521	AGAAAA	2	12	25325	25336	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021521	GAT	2	6	25342	25347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021521	CTC	2	6	25372	25377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_021521	AGG	2	6	25438	25443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021521	ACC	2	6	25485	25490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_021521	TCG	2	6	25542	25547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021521	T	7	7	25591	25597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021521	A	7	7	25599	25605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021521	A	7	7	25607	25613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021521	A	6	6	25649	25654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021521	TAA	2	6	28198	28203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021521	CA	4	8	28263	28270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021521	AAC	2	6	28284	28289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021521	TTTC	2	8	30955	30962	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_021521	AGT	2	6	31383	31388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021521	GATG	2	8	31389	31396	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021521	ATA	2	6	31400	31405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021521	AATTC	2	10	31410	31419	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_021521	AAGC	2	8	31431	31438	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_021521	TA	3	6	31449	31454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021521	A	6	6	31471	31476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021521	T	6	6	34301	34306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021521	AAAATT	2	12	35066	35077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021521	ATT	2	6	35097	35102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021521	TAG	2	6	35121	35126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021521	T	6	6	35148	35153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021521	TAA	2	6	36063	36068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021521	GTA	2	6	36083	36088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021521	CTG	2	6	36095	36100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021521	ATAA	2	8	36148	36155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021521	TAAA	2	8	36223	36230	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021521	TGA	2	6	36239	36244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021521	AATT	2	8	36270	36277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021521	TCA	2	6	36283	36288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021521	A	7	7	38781	38787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021521	AAGAT	2	10	38831	38840	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021521	TTA	2	6	38865	38870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021521	A	7	7	38870	38876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021521	T	6	6	38887	38892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021521	AAC	2	6	38932	38937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021521	TAG	2	6	38973	38978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021521	A	7	7	38987	38993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021521	T	6	6	39000	39005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021521	CTA	2	6	40263	40268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021521	A	6	6	40854	40859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021521	ATT	2	6	40895	40900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021521	TAG	2	6	40911	40916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021521	TTTA	2	8	40953	40960	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021521	AAG	2	6	40967	40972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021521	T	6	6	41845	41850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021521	ACA	2	6	42881	42886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_021521	TC	3	6	42900	42905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021521	T	6	6	42917	42922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021521	ATA	2	6	43021	43026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021521	T	6	6	43478	43483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021521	A	7	7	43496	43502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021521	AACTG	2	10	43506	43515	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_021521	TAA	2	6	43538	43543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021521	TCG	2	6	43566	43571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_021521	TAA	2	6	43577	43582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021521	GTTT	2	8	43633	43640	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_021521	A	6	6	46059	46064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021521	A	6	6	46077	46082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_021521	A	6	6	46161	46166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_021521	TAA	2	6	46206	46211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_021521	T	6	6	52744	52749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_021521	T	6	6	84627	84632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_021521	CAT	3	9	84640	84648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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439	NC_021521	TAT	2	6	117159	117164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_021521	GTA	2	6	119284	119289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
441	NC_021521	ATT	2	6	119593	119598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_021521	GTT	2	6	119599	119604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
443	NC_021521	AATA	2	8	123470	123477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_021521	GAA	2	6	123510	123515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
445	NC_021521	ACA	2	6	123535	123540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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448	NC_021521	A	6	6	127896	127901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_021521	TAT	2	6	127952	127957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_021521	ATC	2	6	127989	127994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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453	NC_021521	TCT	2	6	129084	129089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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461	NC_021521	TAT	2	6	131929	131934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_021521	GTTTT	2	10	131967	131976	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
463	NC_021521	TTAT	2	8	133414	133421	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_021521	TGAT	2	8	133565	133572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
465	NC_021521	AAAAT	2	10	133711	133720	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_021521	ATA	2	6	137310	137315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_021521	ATT	2	6	137372	137377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_021521	ACA	2	6	141735	141740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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